在日米軍第７艦隊所属のミサイル駆逐艦「ラファエル・ペラルタ」は１３日午前９時ごろ、石垣島と竹富島の間にある「検疫錨地」から出航した。米艦船出航を受け、全日本港湾労働組合（全港湾）沖縄地方本部は石垣港で実施していた全面ストライキを解除。午前９時から始業した。このあと、石垣港では終日、港湾作業員らが総出で停滞していた荷役作業に当たった。

　「ラファエル」はこの日、船首を西に向けて出航した。石垣港では、スト解除を受けて貨物船の出入港が急ピッチで進められ、荷役作業に追われる港湾作業員や、トラックの姿で活況を取り戻した。
　全港湾がストを開始した１１日に入港した琉球海運の貨物船「第二優昭丸」は、午前中には荷役作業を終え出港。１２日入港の「陽光丸」の荷役作業も続けられた。午後には１２日入港予定だった「わかなつ」が１日遅れで到着した。
　南西海運は通常１日１隻入港だったが、この日は「ちよ丸」「せつ丸」の２隻が入港した。
　港湾関係者によると、荷役作業は、１３日は物資の降ろし作業が中心で、１４日には運び込まれた物資の配達が行われる。
　港湾作業員の一人は「朝から電話が鳴りやまなかった。少しでも早く物資を届けようとみんな残業して頑張っている」と話した。
　ストによる離島の物流への影響について八重山港運の担当者は「ストが実施されることが前々から分かっていたので、協力会社に出荷の前倒しをお願いし、事前に対策していた」と説明した。
　１１、１２日、米軍関係者は新港クルーズバースから上陸。事業者の大型バスに乗り、大型量販店などに移動し、食料品を大量に買い込むなど買い物を楽しんだ。１３日には新港クルーズバースに設置されていたバリケードも撤去された。