台風１８号の影響で、９月３０日の海、空の便は全面マヒ。南ぬ島石垣空港は朝から閉鎖され、石垣発着便は国内線・国際線すべて欠航し、７６００人余に影響が出た。石垣島と離島を結ぶフェリーも全便が欠航した。観光産業や住民生活に大きな打撃となった。
　日本トランスオーシャン航空（ＪＴＡ）と琉球エアコミューター（ＲＡＣ）は合計３８便が欠航。計４２１８人に影響が出た。３０日午後４時現在、１０月１日午前は欠航、午後は気象情報を確認の上、決定するとしている。
　全日本空輸（ＡＮＡ）は２２便が欠航、計２８３０人に影響が出た。１０月１日はＡＮＡ１７６２便が既に欠航を予定しており、それ以外の運航状況についてはＨＰでの確認を呼び掛けている。
　ソラシドエアは石垣―那覇間の４便が欠航。２９３人に影響が出た。１０月１日は天候により判断としている。ピーチアビエーションは、石垣島と大阪を結ぶ２便が欠航し、３３８人に影響した。
　東運輸（東バス）はバスターミナル発着便は昼過ぎから全便運休となった。１０月１日の運行については、道路状況を調査後に運行を判断する。