台風１８号の影響で、石垣市と竹富町では９月３０日夜から固定電話、携帯電話、インターネットが使えなくなる通信障害が発生した。１０月１日午前に復旧したが、新石垣空港（南ぬ島石垣空港）では台風通過の影響も加わって航空機の欠航が相次ぎ、キャンセル待ちの乗客で大混雑した。

　ＮＴＴ西日本沖縄支店によると、通信障害は３０日午後９時４５分ごろ発生。台風による中継ケーブルの損傷が原因という。通信障害は１日午前８時５５分ごろ復旧したが、２市町で加入電話など約８６００回線、フレッツ光など約１万３５００回線（うち、ひかり電話約７４００回線）、専用線など約４００回線に影響が出た。
　空港では１日▽台風の影響による３０日の欠航▽空港施設同士の情報が遮断されていたことで離着陸できないための欠航▽手続き専用端末の使用不能―など、複数の要因が相まって朝から大混雑した。各航空会社は整理券を配布し、欠航の理由を説明したり、キャンセル待ちの乗客を出発便に合わせて順次案内するなど対応に追われた。
　欠航は日本トランスオーシャン航空で全６便（８９４人）、琉球エアコミューターで全４便（９８人）、全日本空輸で全１１便（約１６００人）あり、計約２５９２人に影響が出た。
　先月２８日から３泊４日のツアーに参加していた千葉県袖ケ浦市在住の前田健治さん（６５）、匡子（きょうこ）さん（６２）夫婦は午前１０時台の羽田行きに乗るはずだったが、午後６時過ぎの便で那覇を経由し、羽田には午後８時前に向かうはめに。
　初の八重山旅行となった匡子さんは「無事に帰れそうだし、これも旅行の楽しみ」、健治さんは「台風だから仕方がないね。千葉はこの前の台風で停電など大変だった。森田健作千葉県知事も、台風の被害の多い石垣に学んでほしい」と話した。
　乗客の案内をしていた航空会社職員は「電話もインターネットもできない状況だった。衛星通信以外で、何かお客様に情報を伝える手段はないものか」と頭を悩ませた。
　気象庁によると、３０日夜から石垣島地方気象台との通信に障害が発生。八重山地方のレーダーデータが利用できないため、解析雨量などの情報の精度低下が起きていたが、１日午前１０時までに復旧した。