石垣島や西表島などの八重山諸島や多良間島で、ジュゴンの個体や食（は）み跡などの目撃情報が２０００年以降に計１１件あったことが、環境省が１６日に公表した南西諸島でのジュゴンの生息状況等に関する情報収集結果で分かった。ただ、写真などの証拠はなく、生息確認には至っていない。
　ジュゴンの生息状況に関する先島諸島での聞き取り調査は２００４年以来、１４年ぶり。環境省は近年、ジュゴンの生息状況の調査が実施されていない八重山や宮古島などで情報収集すべく、１８年度に海運業者や漁業者、研究機関などへのヒアリング調査を行った。
　環境省によると、１８年８月２２日に波照間島で大きさに差のある２頭が、第十一管区海上保安本部石垣航空基地所属の飛行中のヘリコプターから目撃されている。１３年～１４年の春先から夏ごろに西表島北の浜のリーフ内で１頭がシーカヤックに乗った島民により目撃され、１３年６月６日には多良間島周辺で１頭が航空機の乗客により目撃されたという。
　調査結果によると００～０９年までの目撃情報は個体２件、死体２件、食み跡２件、１０年以降は個体３件、糞２件だった。
　環境省の担当者は「仮に生息しているのであれば、最近目撃のない中でうれしいこと。今後も目撃情報の収集にあたる」と述べた。
　環境省はジュゴンを「ごく近い将来における野生での絶滅の危険性が極めて高いもの」とする絶滅危惧種ＩＡ類として、絶滅のおそれのある野生生物の種のリスト「レッドリスト」に挙げている。
　レッドリスト等に基づいて生息状況等をとりまとめて編纂した「レッドデータブック２０１４」では、ジュゴンについて「九州沿岸における迷入例を除けば、１９７０年以降に本種と確認された記録は、沖縄島の中・北部の沿岸水域に限られている」と記されている。